Para borrar un conjunto de grupos funcionales vamos a Administración > Permisos > Conjuntos de grupos funcionales:

En esta pantalla buscamos o identificamos el conjunto de grupos funcionales que queremos borrar, y hacemos clic en el siguiente icono:

Luego confirmamos la acción, y se eliminará el conjunto de grupos funcionales.

Tener en cuenta que para poder borrar un conjunto de grupos funcionales, el mismo no debe estar asociado a ningún usuario o administrador.
De lo contrario nos mostrará el siguiente mensaje:

Lo que debemos hacer entonces es editar todos los usuarios y administradores que tengan asignado este conjunto de grupos funcionales para asignarles el que les corresponda, y luego podremos eliminar el conjunto.